Своїм коріння почитання Пресвятої Богородиці Милосердя дель-Кобре сягає початку ХVІІ
сторіччя, коли два місцеві жителі, разом 10-річним хлопчиком-невільником, знайшли
у морській воді невелику, заввишки коло 50 сантиметрів, дерев’яну статую Божої Матері
з Дитятком Ісусом. Їх дуже здивувало, що незважаючи на шторм, статуя та одяг Пресвятої
Богородиці не були мокрими. Статуя була перенесена в Ель-Кобре (в перекладі з іспанської
мови – «мідь»), де розроблялися численні мідні родовища. 1684 року там споруджено
перший храм.
Поруч із семінарією знаходиться санктуарій Пресвятої Богородиці
Милосердя дель-Кобре, споруджений 1927 року – відпустове місце кубинського народу.
Вранці 27 березня 2012 р., після приватної Служби Божої в семінарії святого
Василія Великого, Венедикт ХVІ відвідав цей санктуарій.